Học viện Pháp thuật Arnold là trường học dành cho giới thượng lưu... và Ray White chỉ là một chàng trai bình thường, nhà nghèo. Trên thực tế, anh dường như không quá thành thạo với ma thuật và có một chút hậu đậu.
Hina, cô đã thức tỉnh như một vị thần, Cô đã thấy trước “ngày tận thế”,Cô ấy đã lựa chọn một chàng trai trẻ đang ế. Ai? Chính là người bạn đồng hành của cô ấy, Để dành thời gian đến những giây phút cuối cùng
30 năm trước, một hiện tượng kỳ lạ được gọi là spacequake (tạm dịch là không chấn) đã tàn phá trung tâm của đại lục Á-Âu, đe dọa mạng sống của ít nhất 150 triệu người.
Câu chuyện diễn ra ở Long Quốc, Nonoko có nhiệm vụ bảo vệ rồng khỏi bị sâu răng. Một ngày nọ, cô phát hiện 1 người lính phe địch bất tỉnh. Tên người lính là Bell và được hồi sinh từ răng rồng. Và cũng là điềm báo sắp xảy ra 1 tai hoạ khủng khiếp. Nonoko và Bell trải qua nhiều trận chiến ác liệt và cuối cùng họ học được cách chấp nhận số phận.
Cốt truyện của Atom The Beginning diễn ra tại Nhật Bản sau một cuộc đại tai vạ. Trong thời điểm hoang tàn đó, có 2 thiên tài luôn mơ về tương lai, đó chính là Umatarou Tenma và Hiroshi Ochanomizu. Cả hai đã làm việc ngày đêm trong phòng nghiên cứu robot - Tenma tạo ra "thần" và Ochanomizu tạo ra "người bạn".